Malgré son statut de chef-d’œuvre, certains spectateurs reprochent au film sa violence psychologique intense qui peut mettre mal à l’aise les publics sensibles. Quelques critiques pointent un rythme parfois inégal, notamment dans le traitement de l’enquête sur Buffalo Bill qui peut sembler moins captivant que les échanges entre Clarice et Lecter. Certains aspects du film ont quelque peu vieilli, particulièrement dans sa représentation de la transsexualité qui peut paraître maladroite selon les standards contemporains. La complexité psychologique, bien qu’étant une force du film, peut parfois dérouter les spectateurs recherchant un thriller plus direct. L’atmosphère constamment oppressante, si elle participe à l’efficacité du film, peut également rebuter ceux qui préfèrent des œuvres moins sombres. Enfin, quelques séquences mineures peuvent paraître moins inspirées comparées à l’excellence générale de l’ensemble, créant de légers déséquilibres dans ce monument du cinéma de genre.